вы сами и ответили на вопрос: если был аванс на который январский вычет предоставлен - тогда будет ровно 13% в феврале. Это в точности совпадает с тем что я написал. Галочка не влияет на предоставления ПРОШЛЫХ вычетов, они предоставляются в любом случае.
Единственный способ не дать прошлый вычет на конкретный источник - не делать ведомость по этому источнику первой. Сделать ведомость по другому источнику. А потом уже по источнику куда "категорически" нельзя применять вычеты
На основании чего с классного руководства должно быть ровно 13%? НК един для всех

Какой вопрос, такой ответ.
Да.

ведомость зарплатная
Разносите в февраль?
Если да, то независимо от галочки за январь вычеты предоставятся. Галочка влияет на вычеты месяца когда доходы попадают в базу.
Ну то есть если ведомость с датой выплаты январь - не будут предоставлены вычеты за январь.
Если ведомость с датой выплаты февраль - январские вычеты будут даны безусловно, а февральские с оглядкой на галочку.

Не говоря уж об извечном вопросе: а какая разница на каком источнике предоставлены вычеты? Никто внятно объяснить не может чего их так эти вычеты беспокоят и на основании чего они ограничивают их применение какими-то источниками.

Приложенная ранее в ответах таблица массовой разноски СОУТ (с номером рабочего места) и возможно автоматически дополнить стаж районным коэффициентом появится в следующем обновлении

Какие ошибки? (можно увидеть хотя бы часть протокола ошибок)
Какой программой проверяете? Вы точно скачали новую версию проверочной?

upd:
На версиях проверочной программы ПО ПД от 12.12.2023 и 27.12.2023 "ругани" на СОУТ нет.
Проверьте версию проверочной, возможно стоит обновить.
Если версия проверочной актуальная, то нужен протокол проверки.

не понятно что значит "массово при аналогичных должностях"
Вы хотите к общему справочнику должностей (штатному расписанию) привязать СОУТ?

Во вложении таблица для массовой разноски
PatchSoutTable.zip

Содержимое SCRIPT скопировать в SCRIPT (если сетевая версия, то на всех местах, кто готовит форму)
Содержимое ZPL скопировать в ZPL (если сетевая версия, то в соответствии с настройками "общности" для копируемых подкаталогов, если они "общие", то в сетевой, если локальные, то во все локальные)

upd: перевыложил архив, там не хватало справочника

Откуда вообще странная идея совпадения баз по страховым и НДФЛ. Особенно в 2023 году.
В 2023 году от этого требования даже ФНС отказалась.

начислили вы зарплату в январе. Вся зарплата попала в базу января по страховым.
А по НДФЛ только аванс, а итоговая выплата за месяц наверное в феврале была? И эта часть зарлаты попадает в базу НДФЛ февраля.

С районным коэффициентом что-нибудь придумаем.