на форуме https://forum.kontur.ru/yaf_postst20576_Prikaz-na-uvol-nieniie.aspx?find=unread#post125427
мы просили Вас прислать дамп или сохранение настроек с лицевым

дамп можно выложить на любой сервис обмена файлами и прикрепить ссылку в сообщение

исправлено в 597.16

Ситуация постоянно повторяется или один раз отвалился sql ?

Исправлено в 597.14

CheckPFR нужна только для проверки отчетов прошлых лет, так получилось что при ее отсутствии пункт меню "проверить отчет" не будет работать для отчетов ФНС (исправим в следующей версии).
Но проверка отчета запускается автоматически при его изменении и сохранении (при включенной настройке "Настройки таблиц и форм печати -> >> Справки и отчеты для ФНС (НДФЛ и т.п.) -> 2. Настройки 6-НДФЛ -> Проверка созданных файлов (Новый режим)" )

Т.е. для проверки можете открыть отчет, изменить любую сумму, вернуть прежнее значение и сохранить отчет, программа сообщит если проверка найдет ошибки (что маловероятно, т.к. проверочная предоставленная ГНИВЦ-ом весьма примитивная - проверяет только структуру xml)

левым он не может остаться

исправим в следующей версии, спасибо что сообщили

Еще необходимо сказать виду что он и по всем подразделениям считает налог, т.е. в столбце C21 тоже нужно поставить *  (если будут источники или объекты то еще C18 и C20)

И скорее всего будет приводить к ошибкам расчета то что у вас итоговые виды налогов отсутствуют в итоговом совместительстве (у которого стоит признак в столбце Осн). 

554 вид может использоваться только для расчета взносов по совместительству, у Вас он считается только по Осн, для взносов по всем совместительствам нужно использовать 'итоговые' виды  (354)  но в вашей настройке такой отсутствует. Если старый 354 вид не используется то нужно его удалить и перенести настройку вида из чистой поставки (в поставке в таблице входимости отметить вид и передать в файл по Alt+F9, затем у себя принять по Alt+F10). Либо можно настроить 554 вид чтобы считался по всем совместительствам - в специальной таблице входимости поставить * в столбце C22

расскажите хотябы что за сервер, как подключены (лучше приложить сохранение настроек)