Антивирусы попробуйте отключить...

Добрый день.

А можно увидеть пример того,что вы сделали с описанием того, что неправильно работает?

Добрый день.

Как вы в программе провели оплату за дни "когда сотрудник не работал с полным сохранением зарплаты"?

Через какой вид? 

Некоторые оплачивают "простои"- тогда нужно исключать из расчета отпуска... , а некоторые сохраняют полный заработок за этот период - на каком основании в этом случае исключать период из расчета?

Как сделать сохраненку?

Добрый день.

Выложите сохраненку с ЛС

Добрый день!

После  "функции для приема из файла" укажите 1 (через запятую). Тогда появится диалог...

У вас нет РК в настройке: 

Настройка -> 4. Настройки параметров расчета -> 4. >>> Настройки для больничных -> 1. Настройки расчета больничного листа -> Расчет минимальной суммы среднего