16.09.2013 релиз 565.1
! число прошлых месяцев можно увеличить в настройках до 120 (Общие настройки системы -> 5. Специальные настройки системы. -> Число прошлых месяцев, хранимых в ЛС)

В выложенной сохраненке 9 раздела не появляется.
Если ошибка стабильно проявляется то выложите пожалуйста сохраненку с этими сотрудниками. В 6-НДФЛ только два раздела. Никакого 9 раздела нет. Скорее всего это какая-то "наведенная ошибка". Первопричина в чем-то другом.

Они готовятся по тем же шаблонам что и в старом интерфейсе. То есть просто в шаблоне увеличить размерность поля. В поставке увеличили до 10.

В 599.9 исправлено.

Если честно, то не очень понимаю зачем мучится с выборкой оклада из базового значения за период, ФРВ за период и НРВ за период, если то же самое можно получить просто выбрав фактически начисленный оклад за этот же период и умножить на процент премии.
Или я не прав?
Или при расчете обычного оклада учитываются не те же дни, которые хочется учитывать при расчете квартальной премии?

Можно из поставочных видов задействовать что-то: 115, 116, 118, 119, 120, 121, 125 - они все на 15 алгоритме.
Если у вас какой-то из этих видов не используется, поменяйте название на "Доплата за увеличенный объем" (полное название) и "ЗаОбъем" (короткое) и пользуйтесь на здоровье.

Что мешает в настройках увеличить количество прошлых месяцев видимых в системе чтобы не менять текущий месяц?
P2MES - это то что стоит в настройке "Настройка -> 6. Общие настройки системы -> 5. Специальные настройки системы. -> Число прошлых месяцев, хранимых в ЛС" (на самом деле читать "видимых в ЛС", как уже было сказано ранее, суммы не удаляем, когда наступил год этак 2011. То есть у всех хранятся суммы примерно с 2005-2006 годов (2011 минус 5 лет)

1) Вроде как у дубликата должен быть заполнен номер того больничного к которому выдается. Можно пробовать его анализировать.
2) Можно смягчить поиск первичного больничного. Можно искать в качестве первичного больничный заканчивающийся в предыдущую дату и позволять его выбирать даже если номер не совпадает (может быть показывая предупреждение).