Подразделение исполняемой должности нужно получать через объект  "CombineList":

  var CL=CreateObject("CombineList");
  if (CL.GetPodr(comb)>0) 
    return CL.GetPodr(comb);

comb- внутренний код 

Даблклик на поле "Сумма" откроет окно "Просмотр выданных сумм"

Тут можно корректировать столбец "Выплата" и добавлять новые строки..

Добрый день.

Никак, это необратимая операция.

Нужно сформировать новую ведомость и скорректировать выплату и НДФЛ( если она будет отличаться)

Добрый день.

Поправьте настройку 

"Суммы для средн. брать по настр. взносов" (Настройка -> 4. Настройки параметров расчета -> 4. >>> Настройки для больничных -> 1. Настройки расчета больничного листа)

В поставке после обновления так же будет...

Форма все еще на тестировании..

В "Обмене с банками" F9 , дабл клик на таблице  "Открытие счетов в УБРиР", еще раз F9

Это поле всегда заполнялось значением 01

Можно поставить нужное значение в функции приема.

А еще лучше использовать более современный формат XML..

Что такое "в самом реестре"?

Вы не ответила на вопрос "Какой формат файла отправляли?"

В файле, который отправляли, номер организации есть?

Добрый день.

Какой формат файла отправляли?

В диалоге при выгрузке в файл для каждого формата есть поле "код организации"