В ЛС уже 100 строк вида -1

Вопрос решил следующим образом. Удалил все виды 101 и 300 которые не содержали сумм, подвел баланс и все разработало

А настройкой почему не воспользовались?

Это не -1 а, вид с внутренним кодом 1

Судя по лицевому счету в программе когда то не очень давно экспериментировали с самым подробным ведением баланса в лицевых (в том числе по объектам), а сейчас по объектам баланс не подводится.
В результате тогда были созданы скрытые виды с кодом 10000 для хранения сумм в ведомость с указанием объекта. Увидеть их можно в старом интерфейсе КЧ по клавише Shift+F9

Автоматически программа похоже не удаляет такие строки в ведомость. 
Если таких ЛС немного то можно вручную удалить эти виды с указанным объектом прямо тут (очень осторожно! по F8 в этом режиме удаляется всегда текущая строка, а не отмеченные)

Если таких ЛС много, то можно сделать страховую копию базы и после этого очистить ЛС с помощью следующей скриптовой функции разноски (в таблице ТН-СУММА убрать функцию приема для суммы и указать функцию разноски return KillVedWithSubject();

KillVedWithSubject()
{
   var MatrLS = GlobalMatrLS();
   int size = MatrLS.Size();
   var map = CreateObject("Map");
   for (int index = 0; index < size; index++)
   {
      var be = MatrLS.GetBaseElem(index);
      if (to_int(be.Code)==10000 && be.Subject!=0)
        map.Add(be.Code, 0);
   }	
   for(map.InitIterator(); !map.IsEnd(); map.Next())
   {
      double cod = map.GetCurKey();
      MatrLS.DeleteRowByCode(cod);
   }
}

Желательно убедиться что в лицевых ничего не пропало после выполнения процедуры. Для этого можно собрать  сначала все данные в выборку "В91. По виду - по месяцам нач./прин. (все месяцы)"
После очистки собрать еще раз выборку и сравнить содержимое с предыдущей (как сравнение файлов или хотя бы итоги и кол-во строк)