Лилия Ралифовна, Вы, наверное, не так меня поняли. Имеется в виду не расчетный счет организации, а документ - счет - который мы формируем, чтобы клиент его оплатил.
Грубо говоря, мы выставляем пять счетов в день по 50 рублей каждый на одного контрагента. Контрагент оплачивает счета все разом  одним платежным поручением на 250 рублей, а не пять п/п по 50 руб. каждое. И когда мы делаем выгрузку из банка в Эльбу, мы можем это поступление в 250 рублей привязать только к какому-то одному счету. Получается, что к одному счету на 50 рублей мы привязываем поступление в 250 рублей, а еще четыре счета остаются без привязки.
Получилось описать проблему?